段奈台吉（?—?），孛兒只斤氏。又稱波兒哈都台吉，16世紀蒙古右翼土默特部領主，俺答汗之孫，辛愛黃台吉的第六子。
段奈台吉在張家口以北、距明朝邊塞二百餘里的馬肺山一帶駐牧。隆慶五年（1571年），右翼蒙古和明朝達成通貢、互市、封職協議，明朝封段奈台吉為指揮僉事。與明朝互市於山西新平市口。萬曆九年（1581年），段奈台吉違約，與明軍發生衝突，明朝停止與他貢市，並由其祖父俺答汗革除官職。萬曆十四年（1586年）、萬曆十六年（1588年），又和明軍發生兩次衝突。後來恢復貢市，之後如約保持和平關係。他沒有後嗣。
