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基因間區段(英語:Intergenic region)又稱基因間隔區,是指穿插在基因與基因之間的DNA序列,這些序列不生產蛋白質,在人類基因組中佔了大多數。
基因間區段的少數序列會影響基因的表現,但大多數序列並沒有作用,或是功能未知。