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馬達加斯加足球協會是專門管轄馬達加斯加足球事務的組織。馬達加斯加足球協會成立於1961年,並在翌年才加入國際足總。此外,它還是非洲足協和南非洲足球協會議會的成員之一。馬達加斯加足球協會曾在2008年3月19日至5月19日期間被國際足總制裁。