孫育萬(?-1895年),清朝官員,本籍中國湖北。 1895年(光緒21年),甲午戰爭後,福建台灣省遭清朝割讓予日。本職為大武壠巡檢的孫育萬奉命接替內渡的邵嘉縝,於福建台灣省擔任台灣府嘉義縣知縣,負責嘉義縣城守備工作。
同年6月,日軍兩路向台灣進攻,10月,接近嘉義的雲林被日軍攻佔。孫育萬與黑旗軍反攻奪回雲林。不過,旋即又被攻佔。之後於嘉義守城戰中,孫育萬仍敗於日軍。月中,他敗逃台南東門。有部分文獻顯示,他不久即陣亡於與日軍交戰中。
- 劉寧顏編,《重修台灣省通志》,台北市,台灣省文獻委員會,1994年。